Né à Amsterdam, élève de Mudra, Herman Diephuis commence son parcours professionnel en 1984 chez Régine Chopinot puis collabore aux créations de Mathilde Monnier, Jean-François Duroure, Philippe Decouflé, François Verret et Jérôme Bel.

En 2002, il chorégraphie La C et la F de La F dans le cadre du projet « les Fables à La Fontaine » puis il présente un travail en commun avec Eszter Salamon et Simone Verde, Répétition publique d'un travail en cours, dans le cadre du programme Hors Séries du Centre chorégraphique national de Montpellier. En 2003, il travaille avec Xavier Le Roy et Alain Buffard et poursuit au fil des années la collaboration avec Mathilde Monnier.

En 2004, il fonde sa compagnie et crée D’après J.-C . (mai 2004) et en projet Dalila et Samson (création novembre 2005 dans le cadre du Festival de Danse de Cannes).