Après avoir commencé sa carrière dans le théâtre avec Brigitte Mercier et Hans Peter Cloos, Serge Ambert est engagé en 1983 au Ballet de l'Opéra de Lyon. Puis à partir de 1985, il travaille avec Christian Taulelle, Andy Degroat, Jean Guizerix et Wilfride Piollet. Entre 1988 et 1993, il travaille avec " Ris et Danceries " dans des chorégraphies de François Raffinot, Francine Lancelot, Béatrice Massin et Ana Yepes.

Depuis 1993, il danse avec la cie Christine Bastin dans Gueule de loup , la Polka du Roi (1996) et le duo Première Neige (1997) intégré à  Be  (1999). En 1997, il commence à travailler avec Jacques Fargearel  Entre Terre et Ciel (1998) et Le soleil des innocents  (2000).

Actuellement, il poursuit sa carrière d'interprète avec Christine Bastin d'une part et Jacques Fargearel d'autre part et a participé à la dernière création de Frédéric Lescure  Vents Vivants .

Depuis janvier 2001, il élabore son propre travail de chorégraphe : Cestou s ni (" Voyage avec Elle "), pièce pour huit interprètes féminines créée à Prague en 2003.

A l'automne 2005, il crée un solo dans une forme circulaire sur le déracinement :  les âmes perdues.  Au printemps 2006, il a créé à Prague un déambulatoire chorégraphique mêlant musiciens et danseurs .